VERBI VEnice Research BIbliography

La scarsa disponibilità di informazioni genetiche su organismi di riferimento dell’ambiente lagunare veneziano rende più difficile delucidare le relazioni funzionali all’interno dell’ecosistema e, in particolare, le risposte biologiche conseguenti a variazioni ambientali. L’evidente carenza di dati di sequenza è stata affrontata in Mytilus galloprovincialis (Lmk, 1819) e Zosterisessor ophiocephalus (Pallas, 1811) con un approccio metodologico già applicato con successo nell’identificazione di geni umani e nello studio dei loro profili di espressione. In ogni cellula e in un certo momento i geni che vengono attivamente trascritti in RNA messaggero, destinati ad essere tradotti in proteine, forniscono infatti un’istantanea, un profilo trascrizionale, che può rendere comprensibili modulazioni funzionali e risposte biologiche indotte.

Qui vengono riportati specificamente i risultati complessivamente ottenuti in Z. ophiocephalus. A partire da tessuti rappresentativi di gò, è stata purificata la popolazione eterogenea degli RNA messaggeri e definita una collezione rappresentativa (libreria di cDNA 3’specifica) il cui sequenziamento sistematico ha fornito i dati di sequenza (1612 3’EST) per procedere nell’analisi informatica e nell’attribuzione di una identità putativa ai trascritti genici (967 sequenze consenso 3’ terminali).

Queste sequenze rappresentano il primo contributo all’identificazione di geni espressi nel gò e rappresentano una preziosa risorsa per ulteriori studi su questo organismo.

This work has been undertaken in the frame of the Research Line 3.6 (Associated Partner P.M. Bisol). The paucity of genetic information on reference organisms of the Venice lagoon makes the understanding of functional relationships within the ecosystem, in particular the biological responses to environmental changes, more difficult.

The evident lack of sequence data has been approached in Mytilus galloprovincialis (Lmk, 1819) and Zosterisessor ophiocephalus (Pallas, 1811) with experimental protocols successfully applied to the identification of human genes and gene expression profiling. In fact, the genes actively transcribed in a given cell and in a certain moment essentially give us a snapshot, a transcriptional profile, from which we may infer functional tuning and Scientific research and safeguarding of Venice snapshot, a transcriptional profile, from which we may infer functional tuning and induced biological responses. The overall results obtained on Z. ophiocephalus are specifically described in thisport. Multiple tissues of the grass goby have been used to isolate the heterogeneousssenger RNAs and, subsequently, to define a 3’end ed the recognition of 967 independent gene transcripts (putative identity equences). These to her research on such organism.