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De Pittà, C., Pallavicini, A., Marsano, F., Varotto, L., Lanfranchi, G., & Viarengo, A., et al. (2005). Understanding the functional responses of "M. galloprovincialis" and "Z. ophiocephalus" by gene identification and gene expression profiling. Scientific Research and Safeguarding of Venice, Corila Research Program 2003 Results, III, 437–442. 
Added by: Dott. Alessandro Meggiato (28/05/2014 16:19:37)
Tipo di Risorsa: Articolo di Rivista
Chiave di citazione BibTeX: DePitt2005
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Categorie: General
Keywords: biodiversità - Biodiversity, extend abstract corila, processi ambientali - Environmental Processes
Creatori: De Pittà, Lanfranchi, Marsano, Pallavicini, Romualdi, Varotto, Venier, Viarengo
Collezione: Scientific Research and Safeguarding of Venice, Corila Research Program 2003 Results
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Allegati     [1/100]
Abstract     
Il consolidamento di metodi della genomica funzionale nell’uomo sta aprendo rapidamente nuove vie alla comprensione della risposta degli organismi ai cambiamenti ambientali. Le variazioni di espressione di geni e proteine in cellule e tessuti specifici possono infatti fornire profili diagnostici e nuovi marcatori per descrivere funzioni fondamentali e risposte indotte di un dato organismo.
Mytilus galloprovincialis e Zosterisessor ophiocephalus sono specie autoctone della laguna di Venezia utilizzate ell’accertamento del rischio ecologico dovuto all’inquinamento e alla antropizzazione dell’ecosistema lagunare (progetto ICSEL, MAV/CVN). Nonostante mitilo e gò siano da tempo oggetto di studi specifici, le conoscenze sui loro geni sono frammentarie o quasi inesistenti.
Nell’ambito del programma di ricerca CORILA 2000-2003 la preparazione di librerie 3’terminali di mitilo e di gò ha reso possibile definire una collezione di 5664 e 1920 EST rispettivamente rappresentative di 1731 and 967 trascritti genici.
L’intera collezione di EST di mitilo ed altre sequenze di controllo sono state utilizzate nella definizione di un cDNA microarray la cui potenzialità d’uso è in corso di valutazione. I primi risultati si riferiscono a mitili trattati in laboratorio con miscele di contaminanti e mitili prelevati da diverse zone dell’ambiente lagunare. I profili di espressione tessuto-specifici relativi a tali mitili indicano la capacità della piattaforma genica (MytArray 1.0) di distinguere effetti indotti da contaminanti diversi e lo stato funzionale di mitili della zona industriale rispetto ad aree lagunari di riferimento. Queste valutazioni trovano continuità nel programma Co.Ri.La 2004-2007 (3.11, WP2.3).

The increasing validation of technologies from functional genomics in humans is rapidly establishing new approaches for studying the organism's response to the environment. In fact, global changes of gene and protein expression in selected cells and tissues can provide diagnostic profiles and new biomarkers for tracing essential functioning and induced responses in reference species.
In the lagoon of Venice, Mytilus galloprovincialis and Zosterisessor ophiocephalus are indigenous species currently used in the multidisciplinary assessment of ecological risk possibly caused by pollution and other human-related activities (ICSEL project, MAV/CVN). Despite the published literature, only fragmentary or very scarce information is available on the gene sequences of these organisms.
In the frame of the Co.Ri.La research programme 2000-2003 the preparation of species-specific 3’end-cDNA libraries yielded a collection of 5664 and 1920 sequenced 3’ESTs, representing 1731 and 967 independent transcript tags for mussels and grass goby, respectively.
The whole collection of transcript-specific mussel 3’ESTs and a number of unrelated controls have been used to define a cDNA microarray which potential application in now under evaluation. The first hybridization data refer to mussels treated with contaminant mixtures or collected from selected sites of the Venice lagoon area. The resulting transcription profiles show the capacity of MytArray 1.0 to discriminate the early effect of different contaminant mixtures and the functional status of mussels living near the industrial district or in reference lagoon areas. Work is in progress within the Co.Ri.La Research Programme 2004-2007 (3.11, WP2.3).


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